Cléopâtre Athanassiou-Popesco a publié nombre d'articles et d'ouvrages sur le développement de l'identité de l'enfant d'un point de vue psychanalytique. Elle est l'auteure de L'Envie: une étude psychanalytique de l'Othello de Shakespeare (Popesco Edition, Paris, 2007). Elle s'est aussi intéressée aux mythes grecs et à leur rapport avec la pensée psychanalytique, comme en témoignent ses publications.