La microbiota es un ecosistema microbiano que está conformado por múltiples bacterias, hongos y protozoarios. Sólo un tercio de la microbiota intestinal es común entre la mayoría de la gente, por lo que las dos terceras partes restantes son específicas en cada persona, de modo que se considera que es única de cada individuo, de ahí que la relevancia del estudio de la microbiota se basa en el descubrimiento de la complejidad de sus funciones y su participación activa en el proceso de salud y enfermedad.
A lo largo de los capítulos en esta obra se hace énfasis en los orígenes de la microbiota, su composición, funciones y métodos de estudio para un mejor entendimiento de ella como órgano metabólico y su participación en el desarrollo de diversas patologías.
En los primeros capítulos se explica de forma detallada la implicación de la microbiota en los procesos fisiopatológicos de las alteraciones metabólicas y los procesos inflamatorios asociados a enfermedades crónicas no transmisibles, como la obesidad, la diabetes, el síndrome metabólico, el hígado graso y el riesgo cardiovascular.
En la segunda parte de la obra se enfatiza el papel de la microbiota en patologías gastrointestinales, insuficiencia renal, enfermedades de la piel, cáncer del tracto digestivo y la importancia de la microbiota en el paciente crítico.